Protein–RNA interactions for Protein: Q91VU1

Yipf1, Protein YIPF1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf1Q91VU1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Yipf1Q91VU1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Yipf1Q91VU1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Yipf1Q91VU1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Yipf1Q91VU1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Yipf1Q91VU1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Yipf1Q91VU1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Yipf1Q91VU1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Yipf1Q91VU1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Yipf1Q91VU1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Yipf1Q91VU1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Yipf1Q91VU1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Yipf1Q91VU1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Yipf1Q91VU1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Yipf1Q91VU1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Yipf1Q91VU1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Yipf1Q91VU1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Yipf1Q91VU1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Yipf1Q91VU1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Yipf1Q91VU1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Yipf1Q91VU1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Yipf1Q91VU1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Yipf1Q91VU1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Yipf1Q91VU1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Yipf1Q91VU1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Yipf1Q91VU1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Yipf1Q91VU1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Yipf1Q91VU1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Yipf1Q91VU1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Yipf1Q91VU1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Yipf1Q91VU1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Yipf1Q91VU1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Yipf1Q91VU1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Yipf1Q91VU1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Yipf1Q91VU1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Yipf1Q91VU1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Yipf1Q91VU1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Yipf1Q91VU1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Yipf1Q91VU1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Yipf1Q91VU1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Yipf1Q91VU1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Yipf1Q91VU1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Yipf1Q91VU1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Yipf1Q91VU1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Yipf1Q91VU1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Yipf1Q91VU1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Yipf1Q91VU1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Yipf1Q91VU1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Yipf1Q91VU1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Yipf1Q91VU1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Yipf1Q91VU1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Yipf1Q91VU1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Yipf1Q91VU1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Yipf1Q91VU1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Yipf1Q91VU1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Yipf1Q91VU1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Yipf1Q91VU1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms