Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smg8Q8VE18 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smg8Q8VE18 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Smg8Q8VE18 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms