Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cep57l1Q8VDS7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms