Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD6

Reep2, Receptor expression-enhancing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep2Q8VCD6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Reep2Q8VCD6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Reep2Q8VCD6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Reep2Q8VCD6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Reep2Q8VCD6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Reep2Q8VCD6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Reep2Q8VCD6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Reep2Q8VCD6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Reep2Q8VCD6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Reep2Q8VCD6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Reep2Q8VCD6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Reep2Q8VCD6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Reep2Q8VCD6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Reep2Q8VCD6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Reep2Q8VCD6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Reep2Q8VCD6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Reep2Q8VCD6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Reep2Q8VCD6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Reep2Q8VCD6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Reep2Q8VCD6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Reep2Q8VCD6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Reep2Q8VCD6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Reep2Q8VCD6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Reep2Q8VCD6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Reep2Q8VCD6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Reep2Q8VCD6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Reep2Q8VCD6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Reep2Q8VCD6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Reep2Q8VCD6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Reep2Q8VCD6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Reep2Q8VCD6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Reep2Q8VCD6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Reep2Q8VCD6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Reep2Q8VCD6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Reep2Q8VCD6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Reep2Q8VCD6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Reep2Q8VCD6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Reep2Q8VCD6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Reep2Q8VCD6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Reep2Q8VCD6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Reep2Q8VCD6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Reep2Q8VCD6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Reep2Q8VCD6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Reep2Q8VCD6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Reep2Q8VCD6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Reep2Q8VCD6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Reep2Q8VCD6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Reep2Q8VCD6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Reep2Q8VCD6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Reep2Q8VCD6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Reep2Q8VCD6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Reep2Q8VCD6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Reep2Q8VCD6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Reep2Q8VCD6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Reep2Q8VCD6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Reep2Q8VCD6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Reep2Q8VCD6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms