Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Polr1eQ8K202 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Polr1eQ8K202 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Polr1eQ8K202 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Polr1eQ8K202 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Polr1eQ8K202 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Polr1eQ8K202 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Polr1eQ8K202 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Polr1eQ8K202 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Polr1eQ8K202 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Polr1eQ8K202 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Polr1eQ8K202 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Polr1eQ8K202 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Polr1eQ8K202 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Polr1eQ8K202 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr1eQ8K202 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr1eQ8K202 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr1eQ8K202 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr1eQ8K202 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr1eQ8K202 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr1eQ8K202 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr1eQ8K202 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr1eQ8K202 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr1eQ8K202 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr1eQ8K202 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr1eQ8K202 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr1eQ8K202 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr1eQ8K202 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr1eQ8K202 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr1eQ8K202 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr1eQ8K202 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr1eQ8K202 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr1eQ8K202 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Polr1eQ8K202 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Polr1eQ8K202 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Polr1eQ8K202 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Polr1eQ8K202 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms