Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nupl2Q8CIC2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nupl2Q8CIC2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms