Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGW4

Sox30, Transcription factor SOX-30, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox30Q8CGW4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox30Q8CGW4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox30Q8CGW4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox30Q8CGW4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox30Q8CGW4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sox30Q8CGW4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox30Q8CGW4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms