Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB19

Phtf2, Putative homeodomain transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf2Q8CB19 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Phtf2Q8CB19 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phtf2Q8CB19 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms