Protein–RNA interactions for Protein: Q8C878

Uba3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba3Q8C878 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uba3Q8C878 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uba3Q8C878 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uba3Q8C878 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uba3Q8C878 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uba3Q8C878 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uba3Q8C878 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uba3Q8C878 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uba3Q8C878 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uba3Q8C878 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uba3Q8C878 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uba3Q8C878 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Uba3Q8C878 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uba3Q8C878 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uba3Q8C878 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uba3Q8C878 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Uba3Q8C878 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uba3Q8C878 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uba3Q8C878 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uba3Q8C878 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uba3Q8C878 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uba3Q8C878 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uba3Q8C878 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uba3Q8C878 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Uba3Q8C878 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uba3Q8C878 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uba3Q8C878 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Uba3Q8C878 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uba3Q8C878 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uba3Q8C878 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uba3Q8C878 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uba3Q8C878 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uba3Q8C878 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uba3Q8C878 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uba3Q8C878 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uba3Q8C878 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uba3Q8C878 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uba3Q8C878 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uba3Q8C878 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uba3Q8C878 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uba3Q8C878 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uba3Q8C878 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uba3Q8C878 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uba3Q8C878 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Uba3Q8C878 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Uba3Q8C878 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Uba3Q8C878 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Uba3Q8C878 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms