Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot2Q8C5L3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot2Q8C5L3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms