Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nek11Q8C0Q4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nek11Q8C0Q4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nek11Q8C0Q4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Nek11Q8C0Q4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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Nek11Q8C0Q4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nek11Q8C0Q4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nek11Q8C0Q4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Nek11Q8C0Q4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nek11Q8C0Q4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nek11Q8C0Q4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nek11Q8C0Q4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Nek11Q8C0Q4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nek11Q8C0Q4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nek11Q8C0Q4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nek11Q8C0Q4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nek11Q8C0Q4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nek11Q8C0Q4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nek11Q8C0Q4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Nek11Q8C0Q4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nek11Q8C0Q4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Nek11Q8C0Q4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nek11Q8C0Q4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nek11Q8C0Q4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nek11Q8C0Q4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nek11Q8C0Q4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nek11Q8C0Q4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nek11Q8C0Q4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nek11Q8C0Q4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nek11Q8C0Q4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nek11Q8C0Q4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nek11Q8C0Q4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nek11Q8C0Q4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nek11Q8C0Q4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nek11Q8C0Q4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nek11Q8C0Q4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
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