Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZL8

Lmo3, LIM domain only protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo3Q8BZL8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmo3Q8BZL8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmo3Q8BZL8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmo3Q8BZL8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmo3Q8BZL8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmo3Q8BZL8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmo3Q8BZL8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmo3Q8BZL8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmo3Q8BZL8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmo3Q8BZL8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmo3Q8BZL8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmo3Q8BZL8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmo3Q8BZL8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmo3Q8BZL8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmo3Q8BZL8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmo3Q8BZL8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmo3Q8BZL8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmo3Q8BZL8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmo3Q8BZL8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmo3Q8BZL8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmo3Q8BZL8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmo3Q8BZL8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmo3Q8BZL8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmo3Q8BZL8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmo3Q8BZL8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmo3Q8BZL8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmo3Q8BZL8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmo3Q8BZL8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmo3Q8BZL8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmo3Q8BZL8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms