Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdcl3Q8BVF2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pdcl3Q8BVF2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms