Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y56

Rbsn, Rabenosyn-5, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbsnQ80Y56 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RbsnQ80Y56 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RbsnQ80Y56 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RbsnQ80Y56 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RbsnQ80Y56 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RbsnQ80Y56 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RbsnQ80Y56 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RbsnQ80Y56 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RbsnQ80Y56 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RbsnQ80Y56 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RbsnQ80Y56 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RbsnQ80Y56 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RbsnQ80Y56 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RbsnQ80Y56 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RbsnQ80Y56 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RbsnQ80Y56 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RbsnQ80Y56 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RbsnQ80Y56 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RbsnQ80Y56 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RbsnQ80Y56 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RbsnQ80Y56 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RbsnQ80Y56 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RbsnQ80Y56 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RbsnQ80Y56 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RbsnQ80Y56 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RbsnQ80Y56 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RbsnQ80Y56 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RbsnQ80Y56 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RbsnQ80Y56 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RbsnQ80Y56 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RbsnQ80Y56 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RbsnQ80Y56 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms