Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc155Q80VJ8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc155Q80VJ8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc155Q80VJ8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc155Q80VJ8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc155Q80VJ8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc155Q80VJ8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc155Q80VJ8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc155Q80VJ8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc155Q80VJ8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc155Q80VJ8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc155Q80VJ8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc155Q80VJ8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc155Q80VJ8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc155Q80VJ8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc155Q80VJ8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc155Q80VJ8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc155Q80VJ8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc155Q80VJ8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc155Q80VJ8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc155Q80VJ8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc155Q80VJ8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc155Q80VJ8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc155Q80VJ8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc155Q80VJ8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc155Q80VJ8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc155Q80VJ8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc155Q80VJ8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc155Q80VJ8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc155Q80VJ8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc155Q80VJ8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc155Q80VJ8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc155Q80VJ8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc155Q80VJ8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc155Q80VJ8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc155Q80VJ8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc155Q80VJ8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc155Q80VJ8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc155Q80VJ8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc155Q80VJ8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc155Q80VJ8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc155Q80VJ8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc155Q80VJ8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms