Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Otop3Q80UF9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Otop3Q80UF9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Otop3Q80UF9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Otop3Q80UF9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Otop3Q80UF9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Otop3Q80UF9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Otop3Q80UF9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Otop3Q80UF9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Otop3Q80UF9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Otop3Q80UF9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Otop3Q80UF9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Otop3Q80UF9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Otop3Q80UF9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Otop3Q80UF9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Otop3Q80UF9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Otop3Q80UF9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Otop3Q80UF9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Otop3Q80UF9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Otop3Q80UF9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Otop3Q80UF9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Otop3Q80UF9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Otop3Q80UF9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Otop3Q80UF9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Otop3Q80UF9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Otop3Q80UF9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Otop3Q80UF9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Otop3Q80UF9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Otop3Q80UF9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Otop3Q80UF9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Otop3Q80UF9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Otop3Q80UF9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Otop3Q80UF9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Otop3Q80UF9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms