Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms