Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ift172Q6VH22 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ift172Q6VH22 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ift172Q6VH22 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Ift172Q6VH22 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ift172Q6VH22 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ift172Q6VH22 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ift172Q6VH22 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ift172Q6VH22 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ift172Q6VH22 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ift172Q6VH22 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ift172Q6VH22 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ift172Q6VH22 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ift172Q6VH22 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ift172Q6VH22 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ift172Q6VH22 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ift172Q6VH22 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ift172Q6VH22 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ift172Q6VH22 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ift172Q6VH22 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ift172Q6VH22 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ift172Q6VH22 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ift172Q6VH22 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ift172Q6VH22 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ift172Q6VH22 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ift172Q6VH22 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ift172Q6VH22 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ift172Q6VH22 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Ift172Q6VH22 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ift172Q6VH22 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ift172Q6VH22 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ift172Q6VH22 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ift172Q6VH22 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ift172Q6VH22 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ift172Q6VH22 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ift172Q6VH22 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Ift172Q6VH22 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ift172Q6VH22 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ift172Q6VH22 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ift172Q6VH22 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ift172Q6VH22 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ift172Q6VH22 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ift172Q6VH22 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ift172Q6VH22 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ift172Q6VH22 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ift172Q6VH22 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ift172Q6VH22 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ift172Q6VH22 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ift172Q6VH22 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Ift172Q6VH22 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ift172Q6VH22 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ift172Q6VH22 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ift172Q6VH22 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ift172Q6VH22 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ift172Q6VH22 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Ift172Q6VH22 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms