Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smchd1Q6P5D8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smchd1Q6P5D8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms