Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Frg2f1Q6P3A2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Frg2f1Q6P3A2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Frg2f1Q6P3A2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Frg2f1Q6P3A2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Frg2f1Q6P3A2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Frg2f1Q6P3A2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Frg2f1Q6P3A2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Frg2f1Q6P3A2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Frg2f1Q6P3A2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Frg2f1Q6P3A2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Frg2f1Q6P3A2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Frg2f1Q6P3A2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Frg2f1Q6P3A2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms