Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Top2bQ64511 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Top2bQ64511 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Top2bQ64511 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Top2bQ64511 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Top2bQ64511 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Top2bQ64511 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Top2bQ64511 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Top2bQ64511 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Top2bQ64511 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Top2bQ64511 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Top2bQ64511 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Top2bQ64511 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Top2bQ64511 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Top2bQ64511 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Top2bQ64511 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.3
Top2bQ64511 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.3
Top2bQ64511 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Top2bQ64511 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Top2bQ64511 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Top2bQ64511 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Top2bQ64511 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Top2bQ64511 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Top2bQ64511 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Top2bQ64511 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Top2bQ64511 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Top2bQ64511 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Top2bQ64511 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Top2bQ64511 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Top2bQ64511 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Top2bQ64511 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Top2bQ64511 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Top2bQ64511 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Top2bQ64511 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Top2bQ64511 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Top2bQ64511 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Top2bQ64511 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Top2bQ64511 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Top2bQ64511 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Top2bQ64511 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Top2bQ64511 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Top2bQ64511 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Top2bQ64511 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Top2bQ64511 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Top2bQ64511 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Top2bQ64511 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Top2bQ64511 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Top2bQ64511 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Top2bQ64511 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Top2bQ64511 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Top2bQ64511 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Top2bQ64511 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Top2bQ64511 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Top2bQ64511 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Top2bQ64511 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Top2bQ64511 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Top2bQ64511 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Top2bQ64511 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Top2bQ64511 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Top2bQ64511 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Top2bQ64511 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Top2bQ64511 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Top2bQ64511 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Top2bQ64511 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Top2bQ64511 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Top2bQ64511 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Top2bQ64511 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Top2bQ64511 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Top2bQ64511 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Top2bQ64511 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Top2bQ64511 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Top2bQ64511 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Top2bQ64511 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Top2bQ64511 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Top2bQ64511 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Top2bQ64511 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Top2bQ64511 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Top2bQ64511 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Top2bQ64511 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Top2bQ64511 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Top2bQ64511 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Top2bQ64511 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Top2bQ64511 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Top2bQ64511 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Top2bQ64511 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Top2bQ64511 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Top2bQ64511 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Top2bQ64511 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Top2bQ64511 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Top2bQ64511 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Top2bQ64511 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Top2bQ64511 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Top2bQ64511 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Top2bQ64511 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Top2bQ64511 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Top2bQ64511 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Top2bQ64511 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Top2bQ64511 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Top2bQ64511 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Top2bQ64511 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms