Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Pou4f3Q63955 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms