Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms