Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufa4Q62425 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufa4Q62425 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufa4Q62425 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufa4Q62425 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufa4Q62425 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufa4Q62425 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa4Q62425 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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