Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd180Q62192 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cd180Q62192 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd180Q62192 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd180Q62192 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd180Q62192 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd180Q62192 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd180Q62192 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd180Q62192 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd180Q62192 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd180Q62192 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd180Q62192 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd180Q62192 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd180Q62192 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd180Q62192 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd180Q62192 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd180Q62192 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd180Q62192 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd180Q62192 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd180Q62192 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd180Q62192 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd180Q62192 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd180Q62192 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd180Q62192 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd180Q62192 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd180Q62192 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd180Q62192 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd180Q62192 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd180Q62192 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd180Q62192 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd180Q62192 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd180Q62192 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd180Q62192 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms