Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itga6Q61739 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Itga6Q61739 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Itga6Q61739 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Itga6Q61739 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Itga6Q61739 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itga6Q61739 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itga6Q61739 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itga6Q61739 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itga6Q61739 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itga6Q61739 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itga6Q61739 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itga6Q61739 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itga6Q61739 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itga6Q61739 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itga6Q61739 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itga6Q61739 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itga6Q61739 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Itga6Q61739 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Itga6Q61739 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Itga6Q61739 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Itga6Q61739 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Itga6Q61739 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Itga6Q61739 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Itga6Q61739 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Itga6Q61739 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Itga6Q61739 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Itga6Q61739 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Itga6Q61739 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms