Protein–RNA interactions for Protein: Q61330

Cntn2, Contactin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn2Q61330 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cntn2Q61330 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cntn2Q61330 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cntn2Q61330 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cntn2Q61330 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cntn2Q61330 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cntn2Q61330 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cntn2Q61330 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cntn2Q61330 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cntn2Q61330 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cntn2Q61330 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cntn2Q61330 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cntn2Q61330 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cntn2Q61330 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cntn2Q61330 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cntn2Q61330 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cntn2Q61330 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cntn2Q61330 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cntn2Q61330 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cntn2Q61330 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.7 ms