Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rbm27Q5SFM8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rbm27Q5SFM8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rbm27Q5SFM8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rbm27Q5SFM8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rbm27Q5SFM8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rbm27Q5SFM8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rbm27Q5SFM8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rbm27Q5SFM8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rbm27Q5SFM8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rbm27Q5SFM8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Rbm27Q5SFM8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rbm27Q5SFM8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rbm27Q5SFM8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rbm27Q5SFM8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rbm27Q5SFM8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rbm27Q5SFM8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rbm27Q5SFM8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rbm27Q5SFM8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rbm27Q5SFM8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rbm27Q5SFM8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rbm27Q5SFM8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rbm27Q5SFM8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rbm27Q5SFM8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rbm27Q5SFM8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rbm27Q5SFM8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rbm27Q5SFM8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rbm27Q5SFM8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rbm27Q5SFM8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rbm27Q5SFM8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rbm27Q5SFM8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rbm27Q5SFM8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rbm27Q5SFM8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rbm27Q5SFM8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rbm27Q5SFM8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rbm27Q5SFM8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rbm27Q5SFM8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rbm27Q5SFM8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rbm27Q5SFM8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rbm27Q5SFM8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rbm27Q5SFM8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rbm27Q5SFM8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rbm27Q5SFM8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rbm27Q5SFM8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rbm27Q5SFM8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rbm27Q5SFM8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rbm27Q5SFM8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Rbm27Q5SFM8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rbm27Q5SFM8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rbm27Q5SFM8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rbm27Q5SFM8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rbm27Q5SFM8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rbm27Q5SFM8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rbm27Q5SFM8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rbm27Q5SFM8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rbm27Q5SFM8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rbm27Q5SFM8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rbm27Q5SFM8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rbm27Q5SFM8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rbm27Q5SFM8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rbm27Q5SFM8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rbm27Q5SFM8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms