Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCQ5

Dph1, 2-(3-amino-3-carboxypropyl)histidine synthase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dph1Q5NCQ5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dph1Q5NCQ5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms