Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Prkaa1Q5EG47 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms