Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTU0

Afap1l2, Actin filament-associated protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afap1l2Q5DTU0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Afap1l2Q5DTU0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Afap1l2Q5DTU0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Afap1l2Q5DTU0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Afap1l2Q5DTU0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Afap1l2Q5DTU0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Afap1l2Q5DTU0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Afap1l2Q5DTU0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afap1l2Q5DTU0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afap1l2Q5DTU0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afap1l2Q5DTU0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afap1l2Q5DTU0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afap1l2Q5DTU0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afap1l2Q5DTU0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afap1l2Q5DTU0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afap1l2Q5DTU0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Afap1l2Q5DTU0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afap1l2Q5DTU0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afap1l2Q5DTU0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afap1l2Q5DTU0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afap1l2Q5DTU0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afap1l2Q5DTU0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afap1l2Q5DTU0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afap1l2Q5DTU0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Afap1l2Q5DTU0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Afap1l2Q5DTU0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Afap1l2Q5DTU0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Afap1l2Q5DTU0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Afap1l2Q5DTU0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Afap1l2Q5DTU0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Afap1l2Q5DTU0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Afap1l2Q5DTU0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Afap1l2Q5DTU0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Afap1l2Q5DTU0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Afap1l2Q5DTU0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Afap1l2Q5DTU0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Afap1l2Q5DTU0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Afap1l2Q5DTU0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Afap1l2Q5DTU0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Afap1l2Q5DTU0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Afap1l2Q5DTU0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Afap1l2Q5DTU0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Afap1l2Q5DTU0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Afap1l2Q5DTU0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Afap1l2Q5DTU0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Afap1l2Q5DTU0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Afap1l2Q5DTU0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Afap1l2Q5DTU0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Afap1l2Q5DTU0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Afap1l2Q5DTU0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Afap1l2Q5DTU0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Afap1l2Q5DTU0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Afap1l2Q5DTU0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Afap1l2Q5DTU0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Afap1l2Q5DTU0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Afap1l2Q5DTU0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms