Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA45

Uncharacterized protein C11orf95 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q4VA45 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Q4VA45 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Q4VA45 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Q4VA45 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Q4VA45 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Q4VA45 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q4VA45 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q4VA45 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q4VA45 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q4VA45 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q4VA45 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Q4VA45 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Q4VA45 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Q4VA45 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Q4VA45 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Q4VA45 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Q4VA45 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Q4VA45 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Q4VA45 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q4VA45 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q4VA45 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q4VA45 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q4VA45 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q4VA45 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q4VA45 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q4VA45 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Q4VA45 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q4VA45 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q4VA45 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q4VA45 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q4VA45 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q4VA45 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q4VA45 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q4VA45 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Q4VA45 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Q4VA45 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Q4VA45 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Q4VA45 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Q4VA45 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Q4VA45 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Q4VA45 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q4VA45 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q4VA45 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q4VA45 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q4VA45 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q4VA45 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q4VA45 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q4VA45 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Q4VA45 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Q4VA45 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Q4VA45 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Q4VA45 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q4VA45 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q4VA45 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q4VA45 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q4VA45 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Q4VA45 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Q4VA45 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Q4VA45 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Q4VA45 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Q4VA45 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Q4VA45 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Q4VA45 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Q4VA45 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Q4VA45 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Q4VA45 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Q4VA45 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Q4VA45 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Q4VA45 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Q4VA45 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Q4VA45 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Q4VA45 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Q4VA45 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Q4VA45 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Q4VA45 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Q4VA45 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Q4VA45 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Q4VA45 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Q4VA45 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Q4VA45 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Q4VA45 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Q4VA45 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Q4VA45 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Q4VA45 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Q4VA45 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Q4VA45 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Q4VA45 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Q4VA45 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Q4VA45 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Q4VA45 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Q4VA45 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Q4VA45 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Q4VA45 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Q4VA45 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Q4VA45 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Q4VA45 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Q4VA45 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Q4VA45 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Q4VA45 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Q4VA45 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms