Protein–RNA interactions for Protein: Q45HK4

Sh2d1b2, SH2 domain-containing protein 1B2, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1b2Q45HK4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh2d1b2Q45HK4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh2d1b2Q45HK4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh2d1b2Q45HK4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh2d1b2Q45HK4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh2d1b2Q45HK4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh2d1b2Q45HK4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh2d1b2Q45HK4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh2d1b2Q45HK4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh2d1b2Q45HK4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh2d1b2Q45HK4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh2d1b2Q45HK4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh2d1b2Q45HK4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh2d1b2Q45HK4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh2d1b2Q45HK4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh2d1b2Q45HK4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh2d1b2Q45HK4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh2d1b2Q45HK4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh2d1b2Q45HK4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh2d1b2Q45HK4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh2d1b2Q45HK4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh2d1b2Q45HK4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh2d1b2Q45HK4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh2d1b2Q45HK4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh2d1b2Q45HK4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh2d1b2Q45HK4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh2d1b2Q45HK4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh2d1b2Q45HK4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sh2d1b2Q45HK4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sh2d1b2Q45HK4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sh2d1b2Q45HK4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Sh2d1b2Q45HK4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Sh2d1b2Q45HK4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sh2d1b2Q45HK4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh2d1b2Q45HK4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh2d1b2Q45HK4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh2d1b2Q45HK4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh2d1b2Q45HK4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh2d1b2Q45HK4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh2d1b2Q45HK4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh2d1b2Q45HK4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh2d1b2Q45HK4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh2d1b2Q45HK4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh2d1b2Q45HK4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh2d1b2Q45HK4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh2d1b2Q45HK4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh2d1b2Q45HK4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh2d1b2Q45HK4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh2d1b2Q45HK4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh2d1b2Q45HK4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh2d1b2Q45HK4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh2d1b2Q45HK4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh2d1b2Q45HK4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh2d1b2Q45HK4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh2d1b2Q45HK4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh2d1b2Q45HK4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh2d1b2Q45HK4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh2d1b2Q45HK4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh2d1b2Q45HK4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh2d1b2Q45HK4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh2d1b2Q45HK4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh2d1b2Q45HK4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh2d1b2Q45HK4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh2d1b2Q45HK4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms