Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
6430531B16RikQ3V2J1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
6430531B16RikQ3V2J1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms