Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZA1

Rcsd1, CapZ-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcsd1Q3UZA1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rcsd1Q3UZA1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rcsd1Q3UZA1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rcsd1Q3UZA1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rcsd1Q3UZA1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rcsd1Q3UZA1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rcsd1Q3UZA1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rcsd1Q3UZA1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rcsd1Q3UZA1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rcsd1Q3UZA1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcsd1Q3UZA1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.3 ms