Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
D130052B06RikQ3UW13 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
D130052B06RikQ3UW13 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
D130052B06RikQ3UW13 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
D130052B06RikQ3UW13 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
D130052B06RikQ3UW13 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
D130052B06RikQ3UW13 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
D130052B06RikQ3UW13 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
D130052B06RikQ3UW13 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
D130052B06RikQ3UW13 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
D130052B06RikQ3UW13 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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D130052B06RikQ3UW13 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
D130052B06RikQ3UW13 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
D130052B06RikQ3UW13 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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D130052B06RikQ3UW13 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
D130052B06RikQ3UW13 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
D130052B06RikQ3UW13 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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D130052B06RikQ3UW13 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
D130052B06RikQ3UW13 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
D130052B06RikQ3UW13 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
D130052B06RikQ3UW13 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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D130052B06RikQ3UW13 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
D130052B06RikQ3UW13 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
D130052B06RikQ3UW13 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
D130052B06RikQ3UW13 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
D130052B06RikQ3UW13 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
D130052B06RikQ3UW13 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
D130052B06RikQ3UW13 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
D130052B06RikQ3UW13 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
D130052B06RikQ3UW13 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
D130052B06RikQ3UW13 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
D130052B06RikQ3UW13 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
D130052B06RikQ3UW13 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
D130052B06RikQ3UW13 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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D130052B06RikQ3UW13 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
D130052B06RikQ3UW13 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
D130052B06RikQ3UW13 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
D130052B06RikQ3UW13 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
D130052B06RikQ3UW13 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
D130052B06RikQ3UW13 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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D130052B06RikQ3UW13 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
D130052B06RikQ3UW13 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
D130052B06RikQ3UW13 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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D130052B06RikQ3UW13 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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D130052B06RikQ3UW13 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
D130052B06RikQ3UW13 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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D130052B06RikQ3UW13 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
D130052B06RikQ3UW13 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
D130052B06RikQ3UW13 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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D130052B06RikQ3UW13 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
D130052B06RikQ3UW13 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
D130052B06RikQ3UW13 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
D130052B06RikQ3UW13 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
D130052B06RikQ3UW13 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
D130052B06RikQ3UW13 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
D130052B06RikQ3UW13 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
D130052B06RikQ3UW13 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
D130052B06RikQ3UW13 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
D130052B06RikQ3UW13 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
D130052B06RikQ3UW13 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
D130052B06RikQ3UW13 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
D130052B06RikQ3UW13 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
D130052B06RikQ3UW13 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
D130052B06RikQ3UW13 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
D130052B06RikQ3UW13 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
D130052B06RikQ3UW13 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
D130052B06RikQ3UW13 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
D130052B06RikQ3UW13 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
D130052B06RikQ3UW13 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
D130052B06RikQ3UW13 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
D130052B06RikQ3UW13 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
D130052B06RikQ3UW13 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
D130052B06RikQ3UW13 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
D130052B06RikQ3UW13 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
D130052B06RikQ3UW13 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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