Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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