Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2f1Q3THK3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2f1Q3THK3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms