Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem104Q3TB48 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem104Q3TB48 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem104Q3TB48 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem104Q3TB48 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem104Q3TB48 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem104Q3TB48 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem104Q3TB48 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem104Q3TB48 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem104Q3TB48 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem104Q3TB48 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem104Q3TB48 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem104Q3TB48 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem104Q3TB48 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem104Q3TB48 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem104Q3TB48 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem104Q3TB48 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem104Q3TB48 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem104Q3TB48 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem104Q3TB48 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem104Q3TB48 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem104Q3TB48 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem104Q3TB48 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem104Q3TB48 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem104Q3TB48 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem104Q3TB48 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem104Q3TB48 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem104Q3TB48 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem104Q3TB48 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem104Q3TB48 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem104Q3TB48 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem104Q3TB48 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem104Q3TB48 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem104Q3TB48 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem104Q3TB48 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem104Q3TB48 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem104Q3TB48 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem104Q3TB48 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms