Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rundc1Q0VDN7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rundc1Q0VDN7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rundc1Q0VDN7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rundc1Q0VDN7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rundc1Q0VDN7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rundc1Q0VDN7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rundc1Q0VDN7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rundc1Q0VDN7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rundc1Q0VDN7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rundc1Q0VDN7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rundc1Q0VDN7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rundc1Q0VDN7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rundc1Q0VDN7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rundc1Q0VDN7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rundc1Q0VDN7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rundc1Q0VDN7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Rundc1Q0VDN7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rundc1Q0VDN7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Rundc1Q0VDN7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rundc1Q0VDN7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rundc1Q0VDN7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rundc1Q0VDN7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rundc1Q0VDN7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rundc1Q0VDN7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rundc1Q0VDN7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rundc1Q0VDN7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rundc1Q0VDN7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rundc1Q0VDN7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rundc1Q0VDN7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rundc1Q0VDN7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rundc1Q0VDN7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rundc1Q0VDN7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rundc1Q0VDN7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rundc1Q0VDN7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rundc1Q0VDN7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rundc1Q0VDN7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rundc1Q0VDN7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rundc1Q0VDN7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rundc1Q0VDN7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rundc1Q0VDN7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rundc1Q0VDN7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rundc1Q0VDN7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rundc1Q0VDN7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rundc1Q0VDN7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rundc1Q0VDN7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rundc1Q0VDN7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rundc1Q0VDN7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rundc1Q0VDN7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rundc1Q0VDN7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Rundc1Q0VDN7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rundc1Q0VDN7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rundc1Q0VDN7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rundc1Q0VDN7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rundc1Q0VDN7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Rundc1Q0VDN7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rundc1Q0VDN7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rundc1Q0VDN7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rundc1Q0VDN7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rundc1Q0VDN7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rundc1Q0VDN7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rundc1Q0VDN7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rundc1Q0VDN7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rundc1Q0VDN7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rundc1Q0VDN7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Rundc1Q0VDN7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rundc1Q0VDN7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Rundc1Q0VDN7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rundc1Q0VDN7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rundc1Q0VDN7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rundc1Q0VDN7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rundc1Q0VDN7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rundc1Q0VDN7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rundc1Q0VDN7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rundc1Q0VDN7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rundc1Q0VDN7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rundc1Q0VDN7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rundc1Q0VDN7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rundc1Q0VDN7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rundc1Q0VDN7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rundc1Q0VDN7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rundc1Q0VDN7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rundc1Q0VDN7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rundc1Q0VDN7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rundc1Q0VDN7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rundc1Q0VDN7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rundc1Q0VDN7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rundc1Q0VDN7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rundc1Q0VDN7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rundc1Q0VDN7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rundc1Q0VDN7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rundc1Q0VDN7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rundc1Q0VDN7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rundc1Q0VDN7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rundc1Q0VDN7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rundc1Q0VDN7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rundc1Q0VDN7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rundc1Q0VDN7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rundc1Q0VDN7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rundc1Q0VDN7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms