Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cib3Q0P523 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cib3Q0P523 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms