Protein–RNA interactions for Protein: Q05948

YLR225C, Uncharacterized SVF1-like protein YLR225C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR225CQ05948 MPM1YJL066C 759 nt6.57□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 PSY3YLR376C 729 nt6.57□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 YOL107WYOL107W 1029 nt6.57□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 UBC11YOR339C 471 nt6.57□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 YMC1YPR058W 924 nt6.57□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 YSA1YBR111C 696 nt6.57□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 HBN1YCL026C-B 582 nt6.57□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 RAD24YER173W 1980 nt6.57□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 GTT3YEL017W 1014 nt6.56□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 YGL262WYGL262W 528 nt6.56□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 YHR054CYHR054C 1065 nt6.56□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 FBA1YKL060C 1080 nt6.56□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 SPO20YMR017W 1194 nt6.56□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 NOP13YNL175C 1212 nt6.56□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 SSU72YNL222W 621 nt6.56□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 ARG8YOL140W 1272 nt6.56□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 BTS1YPL069C 1008 nt6.56□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 snR189snR189 189 nt6.56□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 MRL1YPR079W 1146 nt6.56□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 TAZ1YPR140W 1146 nt6.56□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 MKK1YOR231W 1527 nt6.55□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 BDF2YDL070W 1917 nt6.55□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 HSP31YDR533C 714 nt6.55□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 YML131WYML131W 1098 nt6.55□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 ORC5YNL261W 1440 nt6.55□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 MAD3YJL013C 1548 nt6.55□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 SET4YJL105W 1683 nt6.55□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 HEL1YKR017C 1656 nt6.55□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 SEC18YBR080C 2277 nt6.54□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 HST4YDR191W 1113 nt6.54□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 YLR225CYLR225C 1224 nt6.54□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 YNL143CYNL143C 393 nt6.54□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 TOS6YNL300W 309 nt6.54□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 KTR1YOR099W 1182 nt6.54□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 CRP1YHR146W 1398 nt6.54□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 THI2YBR240C 1353 nt6.54□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 SLA2YNL243W 2907 nt6.53□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 ASN2YGR124W 1719 nt6.53□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 FET3YMR058W 1911 nt6.53□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 YCR016WYCR016W 873 nt6.53□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 INO2YDR123C 915 nt6.53□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 SNM1YDR478W 597 nt6.53□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 YGR182CYGR182C 354 nt6.53□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 PPE1YHR075C 1203 nt6.53□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 SEC65YML105C 822 nt6.53□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 YMR178WYMR178W 825 nt6.53□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 YOR012WYOR012W 414 nt6.53□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 SLM4YBR077C 489 nt6.53□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 EFM2YBR271W 1260 nt6.53□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 CCC2YDR270W 3015 nt6.53□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 FRE7YOL152W 1863 nt6.53□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 FKH1YIL131C 1455 nt6.53□□□□□ -1.36
YLR225CQ05948 SHR3YDL212W 633 nt6.52□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 BUD16YEL029C 939 nt6.52□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 YNL226WYNL226W 411 nt6.52□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 PSH1YOL054W 1221 nt6.52□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 TFB6YOR352W 1032 nt6.52□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 YPL062WYPL062W 405 nt6.52□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 YPR114WYPR114W 948 nt6.52□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 PEX32YBR168W 1242 nt6.52□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 WHI2YOR043W 1461 nt6.52□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 SOG2YOR353C 2376 nt6.52□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 GIT1YCR098C 1557 nt6.52□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 MCH2YKL221W 1422 nt6.51□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 YOS9YDR057W 1629 nt6.51□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 SEC28YIL076W 891 nt6.51□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 PGU1YJR153W 1086 nt6.51□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 YLL047WYLL047W 384 nt6.51□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 YLR118CYLR118C 684 nt6.51□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 YML090WYML090W 387 nt6.51□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 GLN1YPR035W 1113 nt6.51□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 YBR144CYBR144C 315 nt6.51□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 MDM10YAL010C 1482 nt6.5□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 BUD26YDR241W 288 nt6.5□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt6.5□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt6.5□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 YKR032WYKR032W 315 nt6.5□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 YNL296WYNL296W 315 nt6.5□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 RKI1YOR095C 777 nt6.5□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 GPB2YAL056W 2643 nt6.5□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 MAL13YGR288W 1422 nt6.5□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 SRP101YDR292C 1866 nt6.49□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 FET4YMR319C 1659 nt6.49□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 YJR107WYJR107W 987 nt6.49□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 RPN8YOR261C 1017 nt6.49□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 YCK1YHR135C 1617 nt6.49□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 SIT1YEL065W 1887 nt6.49□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 COT1YOR316C 1320 nt6.49□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 PEX31YGR004W 1389 nt6.48□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 PCL2YDL127W 927 nt6.48□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt6.48□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 YBL036CYBL036C 774 nt6.48□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 YNL303WYNL303W 348 nt6.48□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 TIM54YJL054W 1437 nt6.48□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 TFG1YGR186W 2208 nt6.48□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 YHL012WYHL012W 1482 nt6.47□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 COX9YDL067C 180 nt6.47□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 RRP4YHR069C 1080 nt6.47□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 MRT4YKL009W 711 nt6.47□□□□□ -1.37
YLR225CQ05948 YKL151CYKL151C 1014 nt6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 40.4 ms