Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pfdn6Q03958 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms