Protein–RNA interactions for Protein: Q02257

Jup, Junction plakoglobin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JupQ02257 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
JupQ02257 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
JupQ02257 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
JupQ02257 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
JupQ02257 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
JupQ02257 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
JupQ02257 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
JupQ02257 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
JupQ02257 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
JupQ02257 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
JupQ02257 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
JupQ02257 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
JupQ02257 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
JupQ02257 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
JupQ02257 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
JupQ02257 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
JupQ02257 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
JupQ02257 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
JupQ02257 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
JupQ02257 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
JupQ02257 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
JupQ02257 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
JupQ02257 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
JupQ02257 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
JupQ02257 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
JupQ02257 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
JupQ02257 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
JupQ02257 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
JupQ02257 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
JupQ02257 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
JupQ02257 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
JupQ02257 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
JupQ02257 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
JupQ02257 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
JupQ02257 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
JupQ02257 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
JupQ02257 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
JupQ02257 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
JupQ02257 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
JupQ02257 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
JupQ02257 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
JupQ02257 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
JupQ02257 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
JupQ02257 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
JupQ02257 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
JupQ02257 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
JupQ02257 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
JupQ02257 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
JupQ02257 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
JupQ02257 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
JupQ02257 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
JupQ02257 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
JupQ02257 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
JupQ02257 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
JupQ02257 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
JupQ02257 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
JupQ02257 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
JupQ02257 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
JupQ02257 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
JupQ02257 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
JupQ02257 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
JupQ02257 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
JupQ02257 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
JupQ02257 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
JupQ02257 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
JupQ02257 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
JupQ02257 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
JupQ02257 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
JupQ02257 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
JupQ02257 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
JupQ02257 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
JupQ02257 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
JupQ02257 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
JupQ02257 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
JupQ02257 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
JupQ02257 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
JupQ02257 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
JupQ02257 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
JupQ02257 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
JupQ02257 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
JupQ02257 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
JupQ02257 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
JupQ02257 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
JupQ02257 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
JupQ02257 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
JupQ02257 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
JupQ02257 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
JupQ02257 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
JupQ02257 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
JupQ02257 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
JupQ02257 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
JupQ02257 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
JupQ02257 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
JupQ02257 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
JupQ02257 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
JupQ02257 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
JupQ02257 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
JupQ02257 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
JupQ02257 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
JupQ02257 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms