Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stx2Q00262 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stx2Q00262 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms