Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VldlrP98156 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
VldlrP98156 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
VldlrP98156 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VldlrP98156 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
VldlrP98156 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VldlrP98156 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VldlrP98156 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VldlrP98156 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VldlrP98156 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VldlrP98156 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VldlrP98156 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
VldlrP98156 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VldlrP98156 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
VldlrP98156 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VldlrP98156 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VldlrP98156 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VldlrP98156 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VldlrP98156 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VldlrP98156 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VldlrP98156 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VldlrP98156 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VldlrP98156 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VldlrP98156 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VldlrP98156 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VldlrP98156 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VldlrP98156 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VldlrP98156 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VldlrP98156 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VldlrP98156 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VldlrP98156 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VldlrP98156 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VldlrP98156 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VldlrP98156 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VldlrP98156 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VldlrP98156 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VldlrP98156 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
VldlrP98156 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VldlrP98156 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
VldlrP98156 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VldlrP98156 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VldlrP98156 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VldlrP98156 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VldlrP98156 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VldlrP98156 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VldlrP98156 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VldlrP98156 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VldlrP98156 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
VldlrP98156 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VldlrP98156 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VldlrP98156 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VldlrP98156 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VldlrP98156 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VldlrP98156 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VldlrP98156 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VldlrP98156 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VldlrP98156 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VldlrP98156 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VldlrP98156 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VldlrP98156 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VldlrP98156 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VldlrP98156 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VldlrP98156 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VldlrP98156 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VldlrP98156 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VldlrP98156 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1240.8 ms