Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbbp6P97868 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbbp6P97868 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbbp6P97868 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbbp6P97868 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbbp6P97868 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbbp6P97868 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbbp6P97868 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbbp6P97868 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbbp6P97868 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbbp6P97868 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbbp6P97868 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbbp6P97868 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbbp6P97868 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbbp6P97868 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbbp6P97868 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbbp6P97868 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbbp6P97868 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbbp6P97868 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rbbp6P97868 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rbbp6P97868 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbbp6P97868 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbbp6P97868 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbbp6P97868 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbbp6P97868 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbbp6P97868 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbbp6P97868 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbbp6P97868 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbbp6P97868 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbbp6P97868 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbbp6P97868 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbbp6P97868 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbbp6P97868 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbbp6P97868 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbbp6P97868 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbbp6P97868 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbbp6P97868 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbbp6P97868 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbbp6P97868 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbbp6P97868 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbbp6P97868 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbbp6P97868 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbbp6P97868 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbbp6P97868 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbbp6P97868 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbbp6P97868 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbbp6P97868 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbbp6P97868 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbbp6P97868 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbbp6P97868 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.64
Rbbp6P97868 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbbp6P97868 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbbp6P97868 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbbp6P97868 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbbp6P97868 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbbp6P97868 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbbp6P97868 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbbp6P97868 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbbp6P97868 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbbp6P97868 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbbp6P97868 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbbp6P97868 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbbp6P97868 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbbp6P97868 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbbp6P97868 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbbp6P97868 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbbp6P97868 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbbp6P97868 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbbp6P97868 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbbp6P97868 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbbp6P97868 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbbp6P97868 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbbp6P97868 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbbp6P97868 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbbp6P97868 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbbp6P97868 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbbp6P97868 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbbp6P97868 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbbp6P97868 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbbp6P97868 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbbp6P97868 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbbp6P97868 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbbp6P97868 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbbp6P97868 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rbbp6P97868 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms