Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bop1P97452 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bop1P97452 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Bop1P97452 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bop1P97452 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bop1P97452 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bop1P97452 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bop1P97452 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bop1P97452 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bop1P97452 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Bop1P97452 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bop1P97452 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.1 ms