Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Psme1P97371 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Psme1P97371 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Psme1P97371 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Psme1P97371 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Psme1P97371 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Psme1P97371 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Psme1P97371 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Psme1P97371 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Psme1P97371 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Psme1P97371 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Psme1P97371 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Psme1P97371 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Psme1P97371 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Psme1P97371 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Psme1P97371 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Psme1P97371 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Psme1P97371 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Psme1P97371 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Psme1P97371 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Psme1P97371 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Psme1P97371 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Psme1P97371 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Psme1P97371 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Psme1P97371 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Psme1P97371 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Psme1P97371 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Psme1P97371 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Psme1P97371 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Psme1P97371 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Psme1P97371 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Psme1P97371 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Psme1P97371 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Psme1P97371 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Psme1P97371 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Psme1P97371 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Psme1P97371 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Psme1P97371 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Psme1P97371 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Psme1P97371 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Psme1P97371 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Psme1P97371 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Psme1P97371 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Psme1P97371 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Psme1P97371 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Psme1P97371 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Psme1P97371 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Psme1P97371 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Psme1P97371 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Psme1P97371 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Psme1P97371 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Psme1P97371 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Psme1P97371 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Psme1P97371 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Psme1P97371 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Psme1P97371 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Psme1P97371 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Psme1P97371 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Psme1P97371 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Psme1P97371 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Psme1P97371 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms