Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pkp1P97350 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms